王占川死后，儿女们为他修建了祠堂。
祠堂成为一个完整的院落，北房三间，西房三间。北房内设有香案。香案后就是他的坟墓。香案上供着专门从景德镇定做的王占川瓷像，形象逼真，栩栩如生。瓷像前供一甬神主。上书文曰：清偿戴花翎即补都司农商部水利顾问显考占川府君之神主。落款署名：孝男月、青、印、吉敬立。香案一侧又供一甬神牌，文日：供奉绥西河渠总河神王君占川之神位。
祠堂有几个人专门照管，清晨、黄昏三叩头，早晨和晚上各点一炉香。
河套人民为了纪念王占川，在“四大股渠”东建起了一座龙王庙，里面供奉着他的神位。
开发河套的“独眼龙王”离开了人间，但他引黄垦殖的丰功伟绩却永远刻在河套人民的心目中。河套人民将他奉为河神，认为他虽然死了却还在掌管着河套的河水涨落，因而每当遇到河渠水落，田苗干旱，或者河水暴涨，决口成灾时，人们就到王占川的祠堂来祭奠。白天在祠堂摆上整猪整羊，以及一些美味食品供献在香案前；晚上人们就到义和渠和沙河渠等八道大渠里放河灯，祈祷他的神位显灵，祈求降福消灾。
每年农历六月二十八日，河套人民自发地到龙王庙祭奠王占川，并在大渠中放河灯。河灯有两种：一种是用纸做成的灯笼，为了防止水把麻纸泡湿后淹灭灯火，制作灯笼时将麻纸用蜡油浸过，然后再将油灯放入灯笼中，水就不会轻易泡烂麻纸，灯笼可以长时间地亮着飘浮在水面上。另一种是穷人想出的土办法，他们没有钱来置办灯笼，就因地制宜，在西瓜皮中放一盏灯，点着后放入渠水中。夜晚，无数盏灯笼飘浮在大渠的水面上，犹如万家灯火，十分美丽而壮观……这就是河套著名的“放河灯”，也叫“祭河神”。
有一年，河套大旱，黄河水位低，各条大渠进不来水，庄稼要旱死了，百姓人心惶惶。五原人民自发地在王家大院前边搭起了戏台，供奉起王占川的神牌，唱了七天的祈雨求神戏。第八天戏刚散，大雨倾盆，河水大涨，庄稼得以灌溉，人们欢呼雀跃……
河套人民至今仍然使用着王占川开挖的八道大渠，而且会永远使用下去，造福千秋万代。王占川的名字，以及他的传奇人生将永远在河套人民中间广泛传诵。