李成栋杀宣忠伯王承恩。承恩，大兴人，世锦衣指挥佥事。甲申，出为福建都司，隆武正位，累官管锦衣卫事，加今秩。其标下彭鸣京等及故中丞田辟有众数千，皆愿随承恩往召弋阳王。成栋忌之。初八日，两舟相遇于英德县，成栋邀承恩过舟欢饮，至夜阑，佯醉，即席手刃之。
时江西宗室朱由艺入阁。由艺壬午乡举，广东教谕。丙戌闽省乡试同考，受绍武命为侍读。至是入阁，帝旨也。成栋亟命锦衣卫捕系，瘐死狱中。
十三日，大学士朱天麟罢。先是，浔、梧参将陈邦传以功封富川伯，寻以迎驾进思恩侯。成栋归正，先疏入告。进爵庆国公，官其子曾禹右副都御史。帝过浔州，邦传挽留月余，求守浔州，如瞿阁部故事。帝不许，许以居浔、梧。而邦传贿诰敕中书张孟先，使易居为守。为言者追改，然邦传进疏，则直称世守。当成栋未归正时，邦传潜通降启，以故为成栋所轻。兵科金堡承风指劾之。邦传疏辨：“陛下蒙尘两年，并无一位两衙门，何今日议论纷纷若是？以臣为无将，请即遣金堡为臣监军，以观臣十万铁骑。”大学士朱天麟票拟：“金堡从来，朕亦未悉，所请着即会议。”丁时魁，堡之党人也，怒曰：“堡论邦传，即请监军。堡又沦郝永忠，若请其头，亦与之耶？”率科道官十六人直入丹墀，大声疾呼，缴印于内阁。帝方燕语，闻之震惊，翻茶沾服。急谕诸臣照旧供职。天麟即日罢相。然天麟但言会议，固未尝出金堡于邦传也。第金堡往日临清受闯贼官，发其从来，是所深忌耳。
江西自全鸣时受事，能军善守，相持至八阅月。副将杨国柱私降。江南运红夷大炮至，尽日力攻，声闻百余里，山谷皆震。十九日亭午，城破。声桓知不可守，豫使匠为数棺，阖门亲属汉装坐其中，纵火焚之，乃自衣其银甲宝锭赴帅府荷池死。先是，声桓病时，使人问死生于八角庙汉将番君梅钅之神，神曰：“死在浮沤。”至是始验。王得仁突围出澹台门，兵冲不得前，三出三入，遭之者辄死。与谭固山马首相值者再，而不识其为大将军。遂被执，支解。宋奎光城破后二日得之城西空舍，擒见固山，谕之降，不食，乃杀之。姜曰广服儒衣冠死于禊家池。陈芳、黄人龙皆死乱军中。余将不知死状者，大率皆为人所食也。人腊薰膊，充刃廨宇云。
二十八日，起旧辅何吾驺、黄士钅入直。南昌已破，何腾蛟方统诸镇兵围长沙。清乌金王统大兵南下湘潭。马进忠、胡一清等皆走。腾蛟晓起，营壁皆空，乃大恸曰：“五年督师，心血呕尽，而所成竟如是，天也。”遂绯衣坐堂上不去。执见乌金王，劝之降。对曰：“王何患无降官降将哉？果以我为血性男子，何惜一剑。”遂不食七日，且死，谓寺僧曰：“取一瓢河水饮我，是水自衡来，犹吾君之水也。涤肠胃而死，暝目矣。”遂遇害。并擒其夫人某氏及幼子，皆被杀。腾蛟其先山阴人，戍贵州黎平卫。腾蛟生而所居井忽生鱼，鳞具五色，居人异之，号为神鱼井。登辛酉贤书。起家南阳令。时流寇充斥，至邑，辄破走之。后从巡抚陈必谦击贼于安皋，斩首四百级，由是知名。擢武库主事。寻备兵淮、徐，平土贼程肖宇、王道善、张方造等众数万。弘光建号，擢抚湖、广，尽瘁边事，未几晋总督。后左兵犯阙，以讨马士英为名，腾蛟百计沮之，不听。左兵大掠，城中人走避督署者数万。腾蛟以印授家人速持去，独坐于堂。乱兵入，飞矢集几，不为动。良玉使人请曰：“公不行不强，但一语而别。”腾蛟赴之。既登舟，舟遂发，使四裨将守之。行四十里，至阳逻镇。腾蛟骂曰：“吾封疆重臣，岂相从作贼耶？”因自投于江。守者惧诛，亦赴水死。腾蛟顺流数十里，遇渔者救之，得苏。标将熊朝佐等及士卒闻腾蛟在，稍稍来集，家人亦持印至，遂入大冶、通山之间。乙酉四月，良玉死，闯贼被杀。腾蛟自宁州间道入浏阳向长沙。时楚人相传腾蚊入水，浮沉三昼夜不死，有大龟负之登陆，皆以为神，争相从之。监军道章旷、长沙道傅上瑞、督学道堵胤锡各练兵一万，及旧镇马进忠、张先璧、卢鼎等皆次第以兵来会。军声稍振。既而隆武建号，晋腾蛟阁部，封定兴侯。并以章旷、堵胤锡为湖南北巡抚，分驻湘阴、常德为犄角，皆从腾蛟请也。腾蛟令南阳时，雅与王善，故所陈皆报可。及是遇害。章旷亦疽发背卒。
二月，李成栋进兵击赣州，次信丰。高进库遣使乞款，以缓其师。李兵老而懈。进库夜劫之，尽没信丰江中。成栋仓卒手提小号灯，夜半渡江，至江心，忽失所在。后三日，有铁人铁马浮于水面，始知成栋死也。兵部尚书张调鼎、监军道姚生文俱死于乱兵。
三月七日，腾蛟、成栋败问至。赠腾蛟中湘王，谥忠烈。子文瑞夺情拜都御史，监胡一清军，后以病卒。腾蛟死，家中井自是遂无神鱼。赠成栋江夏王。进元胤车骑将军，南阳侯。成栋妻妾四十八房，元胤悉勒死于广署。声桓亦赠王爵。皆设坛祭之。其阵亡诸镇将，俱加赠恤。
以杜永和为兵部尚书，总督两广。敕南阳侯李元胤保扈行畿。封杨大福为安乐伯，罗成耀为宜城伯，马宝为安完伯，四路援剿。又加都督车任重宫保，镇守惠、潮。总兵张世新、张祥等各行分汛。命收海上四姓余众，训练水师。封新会土镇王兴为高明伯，招集义旅。王兴身材短小，相传所谓绣花针者也。又封总统林时望为勇毅将军。
忠贞营李赤心等溃兵于茶陵，由道州入粤西。堵胤锡以胡一清、赵印选兵守衡州，清师至，击败之。胤锡走道州，衡、永俱不守。
瞿式耜疏请兵科给事吴其雷监各营军再出。谆谆以岁月稍暇，财赋优裕，用心尽力，修内治以自固，严外备以自强。且积弊之后易致中兴也。一才一艺之士，靡不收罗幕府。每慨人才凋零殆尽，凡趼足而至者，非怀忠抱义之人，亦乱世取功名之士。人之岁月精神，不用之于正，则用之于邪，安可驱为他人用？故一时咸以桂林为稷下。
四月，孙可望遣楚雄道杨畏知及伪户部龚彝弟龚鼎（永昌人，癸未庶吉士）、伪总兵潘世荣等诣行在，献南金名马，移书求亲王名号。初，张献忠入蜀，屠戮无噍类。收载蜀府金银，道锦江而下。川将杨展截而杀之，重货悉沉于江。献忠遁入贵州，后诛死于西充。其劲旅尚有四部，曰孙可望、李定国、刘文秀、艾能奇，皆去献伪号，自称将军，可望平东，定国安西，文秀抚南，能奇定北。四人者慨然曰：“我辈汗马二十年，破坏天下。张、李究无寸土，甚无谓也。我当归朝，力挈天下而还之，一雪此耻。”遂率众入云南。会沐天波为洞蛮所劫，即提兵讨定诸夷。可望年差长，又稍知文墨，故位第一；定国以能，次之；文秀、能奇又次之，然实等夷无统属。已而能奇死，其将冯双礼主其营事，可望笼之以术，遂兼两部，浸欲自大。
当诸军之从贵阳入滇也，贵阳不置一守。有皮熊者，初名罗联芳，守黔，以范矿荐授总兵。至是，遂以其军入贵阳而据之，报称恢复黔省，驻平越。大学士王应熊还自京师，开幕府于遵义。有綦江人王祥者，委任特专，应熊死而祥据遵义。各疏告行在，言今之入滇者为张贼余蘖，名虽向正，事岂革心，朝廷无为所愚。
及滇使至，朝议以为不可，不行封赏。兵科金堡言：“祖制无异姓封王者。”杨畏知曰：“不与无益，彼固已自王也。一旦降号公侯而能欣然受命者，此纯臣之节，宁可望于若辈。若因其向义，破格明恩，犹幸收用于万一。且法有因革，今时异势殊，土宇非故，犹必执旧法耶？”议久不决。于是龚鼎等先归。
广西之南宁，与滇省之广南壤地相接。而可望来书有不允敕号，即提兵出战等语。陈邦传以两广告急，兵备单弱，密存异志，欲私结可望。其中军武康伯胡执恭者，绍兴人也，谋以原请空敕，私填封可望为秦王。又铸王印，令执恭率兵五百赍赴云南。矫敕所载，崇之以监国，许之以九锡，推以总揽朝政，节制天下兵马，事之以父师。可望大喜，迎拜受敕，宣谕黔、滇文武。款赠执恭，具表称谢。执恭伪称遣使赍奏，灭其表，不以闻也。又请与可望合营，许之。留为总理提塘，以通两粤声息。
时清师入衡州，又败忠贞营于柳州，追至龙虎关而还。先是，正月，金堡参何吾驺，谓与司礼监夏国祥此呼彼应，有若桴鼓。吾驺不自安。五月四日，慈宁太后垂帘召吾驺及堡，为解释之。
督师堵胤锡来朝，道龙虎关，楚镇曹志建遣兵围之。志建，鄞人也，字光宇，世袭沧州卫。清师入京，阖门死王事者九十三人。胤锡初为长沙守，与志建善。时志建为楚将，封保昌伯，有众数万，屯三湘之南界。地险而僻，得免**，志建安之。忠贞营兵败，过其地，大掠。志建恚甚。时胤锡复督忠贞营入卫，志建并憾胤锡，迎入龙虎关，阻随行将士五百人于关外，一夜尽缚而杀之。胤锡寓佛寺中，几不得脱，闻粤西明经何图复方结寨楚、粤界上，使人告以难。图复率兵迎之，因得脱，走至贺县。图复寻为志建所杀。
六月，胤锡至肇庆，召入阁。三日，加督师大学士兼尚书，赐白镪五千锭，使调李赤心、高国勋等于藤、郁间，率之出楚。国勋等皆自成部将，所谓高李十三家者也。自何腾蛟招抚后，请封赤心兴国公，国勋郧国公，协守湖南，名为忠贞营。腾蛟死，堵胤锡抚之。湖南既失，赤心等由郴桂竟趋梧州，大纵**掠。欲入广东，胤锡力主其议。李元胤曰：“我辈为子时，公何不来复广东？今反归后，乃来争广东乎？陛下在此，他来何为？”胤锡语塞而止，移瞿式耜书曰：“上有密敕云，东人握君于掌，一朝不戒，生劫入舟，朕不复有中土之望。唯卿与先生图之。”
初，清师入南都，滇将赵印选同王一青、王永祚出滇勤王。至江西，与高进库战，袭其老营，尽杀其父兄妻子。进库忿，战益力，破滇军。三人走湖南，投阁部何腾蛟。及腾蛟被执，楚地尽陷，三人相谓曰：“吾侪以勤王出滇，因国破君亡，暂依何阁部。今阁部死，军新破，不可复振，将死封疆乎，则吾无封疆责。将就降乎，则当时之出滇者谓何？桂林留守督师仁慈好士，可与共当一面，盍往焉？”收残兵得万余，宵走桂林。式耜大喜，遣使郊迎。但部署不严，所过劫掠。焦琏部将赵兴好刚使气，怒滇兵之横，遂治兵相攻，杀滇兵四五人，几成肘腋之变。式耜亟召焦琏与语曰：“国家危在旦夕，方赖诸将军协力同心，共扶社稷，岂容相斗？”两军皆感泣。琏斩赵兴以谢滇诸将，事始得释。
是时，杨畏知将回滇。朝议赐可望一字亲王章而无封号。畏知西过梧，遇堵胤锡，曰：“可望业自王云南，今赐之印而无国名，是犹靳之也。激猛虎而使噬人，奈何？”胤锡然之，为补牍入。七月，始封可望为平辽王，赐国姓与名曰朱朝宗，定国曰李如靖，文秀曰刘若，爵皆为公。畏知至，可望始知初封之伪，顾深耻之，曰：“为帝为王，我所自致，何藉于彼，而屑屑更易，徒为人笑耳。”仍厚待执恭，屏畏知所赍篆不用也。具疏辞封，曰：“臣惟一意办贼，成功之日，始敢议及封爵耳”。定国、文秀亦辞赐名。可望虽不受爵，然已张皇其称。土司慑服者，修省贡献，已仿亲王礼行事。沐天波亦谦让不敢以公爵均敌。
滇土略定，封黔镇皮熊为匡国公，播镇王祥为忠国公，新兴侯焦琏开国公，防滇寇也。
赵印选遣将王永祚、张明刚同围永州。
八月黄士俊、何吾驺罢。时台谏横甚，金堡等以李元胤为东援，瞿式耜为西援，严起恒为内援，焦琏为外援，朝政在握，辄行白简，政府票拟，置底簿以待之，任其改削。黄、何入直以来，弹章盈箧，至是告归。
遣使以蜡丸封国姓成功为延平王，封蓟国公吴三桂为汉中王，皆不报命。
九月，严起恒独相。是时，清定南王孔有德攻道州。永国公曹志建与战，败，遂出白金二十余万置营中，令曰：“斩一级者赏金一锭。”军士争先赴敌，殊死奋击。清师大败，斩首无算。遣人献捷。
陈邦传镇粤西，横州徐彪、郁林梁士奕各聚兵据境，邦传不能制。闻赤心等至，思借之以为重。乃与盟，结为婚姻，以讨徐彪等，且藉其力以倾东勋。忠贞营遂散处宾、衡境上。居民苦之。邦传亦不能堪，幸堵胤锡之调之出楚也。而赤心等初败于郴州，残破之余，不乐北出，欲请高、雷二郡以息士马。胤锡不可。数日，竟拔营而西。胤锡恚恨病作。
十月，别部刘世俊、刘国昌使人来告，愿从出楚。胤锡悦，亲至浔迎之。
十一月，二刘果至，遣东下梧以待；并檄他镇兵，期以望日北发。忽感寒，疾遂笃，草遗疏，自为诔词。浔流湍急，时舟居且夜半矣，命从者解维放舟。曰：“吾荷国重任，不能免胄赴斗，马革裹尸，今毙命卧榻，死有余恨。固不若自沉于江，葬江鱼腹中耳。”从者力谏乃止。以二十六日卒。赠镇国公，谥忠肃。子世明，是夏先卒于军。
忠贞营次横州，赤心死，高必正统其众。
王永祚、张明刚之围永州也，永城三面距水，二将以陆军临其一面。北帅李斗东坚守，至五月不下。十二月十二日，清定南王孔有德统兵至，衔枚疾走，绕出河外，乘其不意袭其营。自相扰乱，弃甲兵而走，逃入山谷。百姓恨滇营之虐掠也，争缚而献诸定南。唯焦部将张明刚全师而还。留守瞿式耜顿足曰：“吾畜锐两年，一朝奔溃，岂天果不祚明耶？”自是粤西门户危于累卵。
清师遂入南雄，屠之，西上韶州。罗成耀弃城走，至广城，会辅臣何吾驺辇饷至行在，成耀劫之。乃密敕李元胤于席间斩之，以正失守封疆、纵军劫掠之罪。
时郝尚文守潮州，其子囚于南京。已遣人通马部院国柱。及是，清师至潮，尚文遂降。
永历四年（清顺治七年）庚寅正月乙卯朔，帝在肇庆。
南韶报至，百官争窜，家丁沿途杀人。帝将戒舟西上，兵科金堡争之，不得。瞿式耜疏曰：“粤东水多于山，虽良骑不能野合。自成栋归顺，始有宁宇。财赋繁盛，十倍粤西。衣甲粮饷，内可自强，外可备敌。村官兵士，南北相杂。制胜致王，可操券而求也。且韶去肇千余里，强弩乘城，坚营固守，亦可待勤王兵四至。《传》曰：‘我能往，寇亦能往。’以天下之大，止存此一隅，退寸失寸，退尺失尺。今乃朝闻警而夕登舟，不知将退至何地？”疏再上，而帝于九日登舟，十三日解维。百官踉跄就道。提督禁旅都督同知南阳侯李元胤慨然曰：“百官皆去，将委空城以待敌耶。”独监守不去。二十六日，舟至梧州，即舟中为水殿。文武罗列，栖于梧江之滨。
二月，清师围广州。命调陈邦传、高必正入援。邦传久与东镇构隙，且怨金堡等之善元胤也。奉调赴援，意在修怨。
三月，户部吴贞毓、詹事郭之奇、兵侍程源、万翔、礼科李用楫、户科朱士鲲、李日炜等迎邦传意，合疏论袁彭年、金堡、丁时魁、蒙正发、刘湘客罪。马吉翔幸于帝，时窥太后，金堡欲杀之。户部吴贞毓荐县令于李成栋，得贿八百金，金堡奏其事。二人切齿。刘湘客贪，丁时魁富，金堡刻，有所弹劾，金辄先之。袁彭年，中郎子，神宗朝东林苗裔也，与东诸侯善。蒙正发给事，其乡人每除降，辄出五人手，遂为众的。奉旨，彭年反正有功，免议；余下锦衣狱。掌卫事张鸣风鞫之。严起恒请对于水殿，不得入，复率诸臣伏沙滩求免刑。程源立舟顶扬言曰：“金堡即‘昌宗之宠方新，仁杰之袍何在’两语，便当万死。”其声达慈宁之舟。盖堡驳御史吕尔疏，有“臣何人也，而何人也。以仁杰之袍，赌昌宗之裘”语，故源以为言。留守瞿式耜阅邸报，得堡疏，爱其文，怜其遇，至于泣下。上疏申救，谓中兴之初宜保元气，勿滥刑。再疏争之曰：“诏狱追赃，乃魏忠贤弄权煅练杨左事，何可祖而行之？内颁敕布四人罪状，乃出忌者之手。”式耜封还，谓“法者，天下之至公也，不可以飞语饮章，横加考案，开天下之疑。且四人得罪，各有本末。臣在政府，若不言，恐失远近人望。”凡七疏，不报。狱具，杖金堡、丁时魁，削夺袁彭年，而刘湘客、蒙正发亦遣戍。于是马、吴及朝士并恨式耜，思中伤之。
四月，高必正至。李赤心之死也，其党张良筹四虎等一时物故。必正疑邦传药之。邦传亦恨必正等久扰其境。必正率所部西回，惟邦传东出，驻清远，马吉翔等驻三水，俱观望不敢进。时广州被围日久，江宁伯杜永和弃城奔海口。李元胤以檄责之。永和复还广州，为坚守计。乃进永和爵为侯。
五月，掌卫事张鸣凤卧病。忽如梦魇，见青衣人四，求与之坐。随出大牌，谓鸣凤曰：“天子欲来，阎罗查验幽冥兵册，先取官四十八员，听分职事迎候，故来延公耳。”鸣凤视牌，果得四十八名，而俱不注衔。内为鸣凤熟识者共一十八人，皆行在文武也。遂默识之。既醒，令人记籍其名，为内阁王化澄、兵侍程源、提督太监徐元、尚宝大监周进贤、锦衣卫王之臣、国舅王惟让、皇亲姜佐周、京营总兵刘大用、张应举、礼科朱士鲲、清近司陈家相、勇卫旗鼓沈天德、西宁侯宋国柱、祁阳伯杨奇、藩镇军门朱容藩、朱盛浓、援剿督镇成大用及鸣凤也。至是鸣凤疾卒，余皆相继病殒，惟宋国柱、杨奇尚存焉。
高必正与兴平侯党守素率兵自梧州来朝，而李元胤亦至自肇庆。慈宁垂帘召三帅赐封，元胤伏地请死曰：“金堡等非臣私人，果有罪，皇上何不处之于端州？今若此，是臣与堡等为党也。向以封疆急，不敢请罪，今已稍定，敢请其罪。”帝慰勉再三曰：“卿大忠大孝，朕不疑卿。”元胤曰：“皇上既不疑臣，何故以处四臣之故赐臣敕书、令臣安心办事乎？慈宁曰：“卿莫认金堡等是好人，卿如此忠义，他却谤卿谋反。”元胤曰：“说臣谋反，还是有本？还是面奏？还是传言？”帝不答。必正曰：“皇上重处堡等，是也。但处堡等之人，不如堡等，处堡等之后，亦无胜堡等之事。”慈宁曰：“只滇封一事，岂非金堡误国？”诸臣皆不敢对。
六月，广西巡抚鲁可藻以丁艰去职，登舟将发，永国公曹志建、榷税官刘成玉劫其资。宣国公焦琏闻之，怒，即遣兵讨成玉。成玉奔永国军。两国几治兵相向。前行人司瞿共美时在恭城，闻之，致书永国曰：“方今天子蒙尘，强敌四逼，唯藉群公固廉兰之交，继桓文之烈。乃忘君父之大仇，修细人之微隙，后世以此为何等举动哉？”志建悟，即杖杀成玉。兵始解。
七月，焦琏帅师入卫。
八月，孙可望遣伪总兵常荣率兵三百人至梧州，入贡黄金一万两，良马一百匹。复以黄金四万贿朝贵。疏奏列秦王衔，且以不愿改封为请。廷臣愕然，谓可望既归诚，不合以私封擅奏。因召荣面质之，曰：“是奉上恩，遣胡执恭亲赍敕宝所封。”于是诸臣始知为邦传矫旨。因议秦王乃亲藩上十五王之首，轻犯宗牒，有违祖训。但国家多事，须恃滇、黔为援，宜姑与王爵。惟更易字样，另遣敕谕为可。匡国公皮熊首参可望不道。留守瞿式耜疏请斩胡执恭以正欺君辱国之罪。有言于帝者，曰：“不若赐之玺书，直云皇帝致书秦王，则前此葛藤斩断。”已允行矣，而高必正出疏争之。阁臣严起恒亦坚执不许。会内江杨鼎和至梧，力言王封之非。起恒悦，授鼎和兵部尚书。议遂寝。由是可望怨两人次骨。
既而朝议拟封冀王，遣太监夏国祥赍敕宣谕。俄闻国祥被杀于养利州桥下。再遣司礼监赵进赍赴，复报中途被劫，羁进不遣。又遣御史姜尔文入黔、蜀联络，道经可望营，亦留不遣。盖可望惟患朝使之宣扬真伪也，故但系朝使未经人耳目者，密杀之，否则留禁之。皮熊在黔，畏其相逼，九月，遣官李之华通好称盟。可望致书曰：“贵爵坐拥貔貅，战则可以摧坚，守则足资保障。独是不肖有司，罔知国本，征派日烦，民生日蹙。黔中多兵出之途，宁无救灾恤邻之念，而以不谷为假道长发之举。若黔若滇，总属朝廷封疆，留守留兵，无非绸缪粮糗。惟欲与行在声息相通，何有一毫私意于其间？若止以一盟了局，为燕雀处堂之计，非不谷所望于君子矣。”熊得书，愈惧，避之苗寨。黔中院司道官会请前军都督白文选入黔省。可望下教安定之，遂下平越，收其军。令所属文武呈缴滥札，武职加授总制参游，文职加授监军督饷，部卿佥宪，概行裁革。
王祥招乌合六七万，分为三十六镇，与滇兵一战于乌江河而大溃。祥乃裹其文绣、珠玉、金宝之属，作竹夹三千背，使牙将负之先驱。众心尽懈，多送款可望。可望掩击之。祥夜走。牙将已劫其赀而去。比晓，失妻子，从者仅百余骑。追者至，祥率死士数十人短兵接战。创重，自刎死。可望遂下遵义。于是宝庆驻镇南阳侯张先璧、马进忠等，由湖南入黔，皆归可望。其势益张，地与粤西相接。
十月，清师陷广州。范承恩迎降，杜永和率舟师入海，奔琼州。
十一月五日，清定南王孔有德入桂林。初，式耜分布赵印选、胡一清与焦琏、杨国栋等兵扼榕江，及是，一清等佯以分饷入桂，榕江其空壁也。武陵侯杨国栋、宁武伯马养麟方驰出小路，军榕江，未见敌而四溃。式耜发使趣印选兵出城。城中大乱，沿途驱掠。式耜令戢不得。城外溃兵，云飞鸟散。水东门外烟火蔽天，鸣镝声绕城。靖江王及绥宁侯蒲缨出走，王世子及其次子俱缢于宫中。式耜方巾行衣，危坐署中。胡一清跃马入署曰：“至矣，至矣。公上马，且从一清去。”式耜曰：“去何之？从一清去，何如从留守？”因举杯属一清曰：“能饮酒乎？”一清曰：“今日岂饮酒时？”遂跃马遁。
江陵张同敞号别山，故相居正孙也，以总督监胡一清军于灵川。已南走矣，中道问瞿公安在？曰：“尚在城。”同敞曰：“安可使留守独殉社稷？”遂回从江东泅水过江，不入寓，过式耜署。式耜喜曰：“同敞至，我死不孤矣。”同敞曰：“事迫矣，公将奈何？”式耜曰：“封疆之臣，知有封疆耳。”同敞曰：“然君恩师义，敞当共之。”式耜曰：“子无留守之责，可以去。”同敞正色曰：“死则俱死耳。”遂留，与式耜饮。明灯正襟而坐。督标戚良勋牵三马至，跪而请曰：“公为拥戴元老，系国安危。身出危城，尚可号召诸勋，再图恢复。”式耜曰：“四年忍死留守，其义谓何？我为大臣，不能御敌，以至于此，更何面目见皇上、提调诸勋乎？”遣之出城。复有家人泣请曰：“当忍须臾，次公子从海上来，二三日且至，万里赴行在，乞一面而诀。”式耜曰：“吾重负朝廷，尚念及儿女耶？”亟挥之曰：“去，毋乱我。”
厥明六日，清师入。二公衣冠南面坐，兵士望见，以为神，不敢入，乃发数千人围之。被执。式耜欲入与妾诀，同敞牵臂止之曰：“徒乱人意耳。”遂行。见定南。定南曰：“汝阁部耶？好阁部。”式耜曰：“汝王子耶？好王子。”定南箕踞于地，曰：“坐。”式耜曰：“我不惯趺坐。”定南肃然起，且揖之。见同敞，曰：“汝何人？”左右命之跪。敞大骂曰：“汝非我毛姻家仆耶？提溺器时，谁为汝跪？”定南大怒，厉声曰：“余大圣人之后也。”敞曰：“汝等已为虏，辱侮先圣，罪当死。”定南气咽，直前批其颊。旁武士或牵项，或以刀背折足，强作跪状。敞大骂，不屈。牵去，将斩之。式耜正色叱曰：“张司马国之大臣，不得无礼。死则吾同死。”定南素重留守，悚然遂止。因曰：“某年二十起兵海上，横行山东，南面称孤。后为清将，赐号称王，拥众数万，任以南方之事。富贵如此。公今日降，明日亦然。《语》曰：‘识时务者呼为俊杰’。清自甲申乘闯贼之变，躏入中国，五年之间，南北一统。天时人事，意可知矣。公守一城捍天下，数年于兹，屡挫强兵，能已见于天下，尚复谁为乎？不若转祸为福，建立非常，以事明者事清，毋忧富贵。空以身膏草野，谁复知之？”式耜曰：“汝为丈夫，既不能尽忠本朝，复不能自起逐鹿，称孤未几，甘为鹰犬。俊杰固如是乎？尚得以时务富贵欺天下男子耶？本阁部无功德异能，受累朝大德，位三公，兼侯伯，常愿殚精竭力，扫**中原。今志不就，自痛负国，虽刀锯汤镬，百死莫赎，尚蒙耻求活耶？一死足矣。毋多言。”定南知不可屈，愈欲降之。同敞叱曰：“岂有天朝大臣降者？”定南愈重之，馆两人于别所，防御甚严，而供张饮食如上宾。
式耜日与同敞赋诗，慷慨赓和。清臬司王三元、苍梧道彭旷，皆式耜里人也，定南使说以百端。不应。复进曰：“国家兴亡，何代无之？生若朝露，何自苦如此？公可剃发为僧，自当了悟。为世人所不能为，岂仅仅守拘儒之节耶？”式耜曰：“僧者，降臣之别名也。佛即圣人，圣人，人伦之至也，未识人伦，何谓了悟？”王、彭见其至诚，喟然曰：“嗟呼！此真正人。”不敢复言。
会式耜遣死士遗焦琏书，极言清兵羸弱、城中空虚状，劝琏急提兵抵桂林。且曰：“中兴大计，毋以我为念。”逻卒得之以献定南，定南大恐。
闰十一月十七日晨，请二公。式耜方食。食彻，与同敞振衣出。谓敞曰：“我两人多活四十一日，今事毕矣。”敞曰：“快哉！行也。今日获死所。”士卒皆为泣下。二公颜色不变，洋洋如平时。敞藏一白网巾于怀，至是服之，曰：“为先帝服也，将服此以见先帝。”至独秀山下，式耜指曰：“一生只爱泉石，愿死于此。”整衣冠争就刃。俱被害。日色无光，大雷冬发。远近士民皆为流涕。同被难者，旗鼓陈希贤、锦衣卫杨芳龄、家人陈祥。
先是初三日，式耜知桂必不守，遣坐营徐高赍印、谢表赴行在。道阻，匿阳朔山中，清师获之。至是亦同殉难。滇营一卒怨同敞，剜其心食之。定南怒，戮之于市。
清将马蛟麟莅杀，雅重式耜，以苇席覆之，加土其上。时给事金堡已为僧矣，上书定南，请收葬。许之。越三日，侍御姚端、式耜门下客吴江、杨艺入王邸，谋殓两公。启视留守，刃血在颈，身首不殊，面如生。两人抚之而哭，曰：“忠魂俨在，知某等殓公乎？”忽张目左右视，杨抚之曰：“次子未见耶？长公失所耶？”目犹视。端叩首曰：“吾知师心矣。天子已幸南宁，师徒大集，焦侯无恙。”目始瞑。遂具衣冠殓，浅葬两公于风洞山之旷地。姚端筑室其旁，与清凝上人守墓不去。事闻，赠式耜粤国公，谥文忠，赠同敞江陵伯，谥文烈。临难诗载在《浩气吟》。
时广州亦先四日为清平南王尚可喜所破。报至梧州，帝于十一日登舟幸浔州。勇卫提督周金汤大掠梧州。陈邦传在清远闻之，飞帆先归，邀帝于藤江，将谋劫之以为重。十二日，帝舟冲雨而过，邦传谋不及发，而百官及卤簿之舟在后者，邦传劫之于江。杀部郎潘骏观、童英、许王凤等，以帝卤簿陈列营中。帝及三宫易小舟前行。十六日，至浔州。二十八日，驻跸南宁。马吉翔、李元胤追从后至。从官稍集，饥冻无人色。括行囊并吉翔所献得四千金，散给之。
十二月，勇毅将军林时望以京营溃散空虚，捐赀招募，收集游兵数千，及是方至。戎政马吉翔所部皆失，忌时望独拥重兵，遂与庞天寿等密奏时望逗留有异志，不早图，变在肘腋。时望初至，十七日早，矫命犒兵，预令健丁即演武场擒时望，以弓弦勒死。时望本黄得功偏将，貌极伟丽，胆力过人。自入行畿，保扈功最著。虽骄悍如郝永忠等，皆严惮之。时望被害，于是禁旅无人。
永历五年（清顺治八年）辛卯正月乙酉朔，帝在南宁，行殿受朝贺。
十日，祀太庙。谕东阁大学士文安之督师经略楚、豫，赐上方剑，便宜行事。
时赵印选率兵入行在，鼓噪拔饷，搜括宫中簪珥及布帛ブ褥绵絮等物而去。
二月，孙可望遣伪将军贺九仪、总兵朱养忠、张明志、张胜等率兵入卫南宁。初，以冀王封可望，终以不允秦封，切齿朝士。监军杨畏知曰：“秦固美号，然假何如真？”可望不悦。李定国等亦劝可望趣畏知行以终始之。畏知行未至，可望已遣贺九仪等至南宁，求阻秦封者而甘心焉。九仪朝见后，使人盗杀杨鼎和于昆仑关，即舟中杀阁部严起恒，投尸于水，随杀兵科张载述、刘克珍、吴霖等于各署。朝臣惶怖。庞天寿、马吉翔叩请之，九仪曰：“前者国主请封，此数人实阻之，故奉令来杀之耳。”天寿等具以邦传擅封、今已改造册宝、赍颁前去告之，九仪唯唯而退。起恒死三日，有渔者报云：“江中有浮尸顺流至，一大虎入水负之入山，以爪掊土，方事葬埋。”时贺九仪在司礼监署，闻之，遣人往视。虎尚在旁，墓已成矣。虎见人，乃摇尾缓行去。九仪亦为惊叹。杨畏知入朝。诏进东阁大学士，入直办事。畏知，陕西宝鸡人，举乡试第一。崇祯庚辰，以保举特用，历官云南金沧道。好言王霸之略，故为可望所重。及朝行在，帝以孙氏故，引之内阁。畏知疏辞再三，不允。九仪谮之可望，遂疑其贰心于己。
三月，三宫上田州。
二十五日，贺九仪修行宫，为帝驻跸。
是月，遣使偕贺九仪赍补秦王金册于可望。可望大喜，远迎拜受。随遣伪中书杨惺先奉表称谢，略云：“秦王臣朝宗望阙奏谢。臣自入滇以来，纪年而不纪号，称帅而不称王，正欲留此大宝，以待陛下之中兴。此臣耿耿孤忠，矢之天日者也。”诸臣得疏，额手相庆。
四月十二日，太后王氏崩于田州。十四日，讣闻。十七日，成服。二十三日，奉安灵舆于慈宁宫。丧礼以日易月。
先是庚寅十月，式耜遣孙检讨昌文入行在，辞世袭临桂伯爵印，且陈桂林不可守状。闻警，辞朝，同巡抚鲁可藻、御史朱田麟间道而上，阻山中。至是月，为叛将王陈策扶之以出，至梧州。大学士方以智为僧在大雄寺，闻昌文将至，谓清将马蛟麟曰：“瞿阁部精忠，今古无两。其长孙来，汝能以德绥之，义声重于天下矣。”蛟麟以为然，厚遇之。浙人魏元翼，式耜以墨吏黜之，迁怒昌文，谮于清将，执之至桂，将甘心焉。未至一日，元翼家中铁索铿然，绕室有声。元翼伏地请罪。忽吴语曰：“汝不忠不义，乃欲杀余孙耶？”元翼叩头乞缓三日，少毕家事。又忽楚语曰：“此不义奴，速杀之，奚问焉？”九窍流血而死。定南王疾，遣将祷于城隍神，恍忽见宫詹司马四大字，入殿见司马俨然南面。大惊，拜归以告。定南骇甚，供双忠神位于铁佛寺。而昌文适至，定南因厚礼之。昌文遂迁留守柩于明月洞。清凝亦迁司马之柩与夫人合葬焉。司马无子，女适兵部主事吴重义。清凝改葬之晨，而重义夫妇适至。清凝者，阳羡人，不谈禅、能急人难。入粤西，式耜爱而礼之。桂陷，清凝在昭平，同式耜次子玄锖崎岖赴难。走至永安州，遇兵，玄钅育失于路，清凝仓猝入桂林，而留守已殁。玄锖自庚寅三月航海觐亲，备尝艰苦，至十月始至粤西。万里寻亲，不获一见。哀哉！后玄锖或云已死，或云入滇，不知所终。
五月，孙可望谕九仪械畏知还滇。可望怒叱曰：“遣尔至粤，所行何事？且尔做内阁耶？”畏知曰：“此由圣恩。畏知三疏力辞，不蒙俞允。业已报闻久矣。”可望曰：“果尔，即宜潜还本国，尔宁做得内阁耶？”畏知愤然曰：“殿下已归正，遣畏知请驾。畏知在朝，乃欲为殿下行尊周盛事。假令畏知不可为内阁，殿下何以独可为秦王乎？”可望大怒，命从军法，欲胁之使改，逆知必有谏者。畏知昂首即出。时安西、抚南等咸在旁，谓可望曰：“我等欲行大事，如此人尚须留下。”可望即谕传宣：“且留他死。”而畏知已戮矣。可望恨曰：“杨公死，我桓文事不成矣。”
是月十八日，敕鸿胪寺曰：“顷以忧戚之中，不遑亲政。今值服除，当面与辅臣商决政事，兼行日讲。该寺即传工部修中极殿。翰林院举堪日讲记注员名，以二十七日举行。”
六月，帝患足痛。
七月十五日，中元，遥祭祖陵。十八日，葬太后于两江之宋村山，谥孝正。
九月，陈邦传叛降于清定南王。南宁震恐，帝议移跸，人心惶惶。庞天寿、马吉翔素与贺九仪有成约，力排众议，坚请向黔。
十月，九仪入朝，谓廷臣曰：“昔秦王为请移跸滇、黔，特命我扈驾。今诸臣既各疑贰，我岂能担此重任乎？”遂撤营去。帝遣官赍留。不应。
十一月，南阳侯李元胤疏请航海。不允。
十二月，初十日，帝至濑湍而南宁陷。太仆寺少卿丁元相、户部员外郎杨尚甸死之。开国公赵印选报清师已过新宁州，从陆路追袭，仅隔百余里。于是君臣悉登陆，焚舟楫，踉跄失次，扈跸官员相失。皇嫂桂恭王妃亦不能相顾而弃之。
十一日，帝由土司入黔境，至逻江界已三十余里。清帅线国安以精兵追蹑于后。尘掩其舆，群臣相顾失色。国安行次，遇白发老人，问曰：“永历何往？汝见之乎？”答曰：“见逻江土官迎驾入土司矣。”又曰：“去此几何？”答曰：“止半日程。但山峻路狭，恐大马难行。”言已，遂入深篁中。国安视西日就山，即令驻营。协镇马雄趋进曰：“永历相去不过三十里，何以不追？”国安曰：“我奉令取南宁，未闻令进土司也。若连夜追袭，或有疏失，谁任其咎？”雄闻唯唯。遂同还南宁。次日，乡民以闻，云清兵已回，上下稍安。及过逻江，猝遇可望所遣总兵高文贵、陈国能、狄三品等讨皈朝叛夷，方还师，乃相率扈跸。可望致书从官曰：“南宁不守，当走安隆。”从之。
是冬，宋国柱、杨奇扈从入滇，舟覆溺海中死。卒如张鸣凤之梦云。
永历六年（清顺治九年）壬辰正月癸酉朔，帝野次。三日，至皈朝。十一日，发皈朝。十二日，次富川。十三日，次沙斗，十四日，次西洋江。十五日，次宝月关。
十六日，至广南。孙可望遣总兵王爱秀迎驾，上言：“臣以行在孤处僻粤，再次迎请，未奉允行。然预虑圣驾必有移幸之日，所以先遣各营兵马肃清夷氛，道路无碍。广南虽云内地，界邻交趾，尚恐夷情叵测。臣再思维，唯安隆所（隶贵州晋安县）滇、黔、粤三省会区，城郭坚固，行宫修葺。一切粮储，可以朝发夕至。莫此为宜。”帝允之。
二十五日，发广南，次童卜。二十六日，次晒和。二十七日，次鼎贵。二十八日，次加浦。二十九日，次那年。三十日，次侄堂。二月癸卯朔，次呼马。二日，次扁牙。三日，次板屯。四日，次板桥。五日，次峒沙。六日，至安隆所。可望遣总兵张胜屯兵安隆城外，来谒，请易安隆所为安龙府。又遣督捕张应科为总理提督，实用以阴制帝也。凌逼百端，无复人臣礼。其疏辞云：“人或谓臣欲挟天子令诸侯，不知彼时尚有诸侯，诸侯亦尚知有天子。今天子已不能自令，臣更挟天子之令以令于何地？令于何人？”
九日，遣太常寺少卿吴之俊赍玺书至滇。
三月，可望欲入安龙陛见。伪兵部任馔进曰：“国主欲入安龙，恐二龙不便相见。”可望遂止。馔博学能文，尤善太乙六壬。常语人曰：“明运已终，事无可为矣。”曾具启劝进，称为国主，设六卿，铸兴朝通宝，以干支纪年，可望昵之。故闻言遂止。惟谕令应科奏报，每年进膳羞银二千两、米六百石于府仓库支给开报而已。于是伪知府范应旭直署于簿曰：“皇帝一员，后妃几口，月支银米若干。”可望见之，恬不为异。
帝日居宫中，一筹莫展。从宫纷纷告艰请俸，则悉搜所用金银器皿销毁济之。或所给银米已至，即用以呼卢取快，否则灌园怡情，不复计军国一事。
四月，清平西王吴三桂由汉中统兵入四川。可望守将白文选走回云南。定南王孔有德自广西以七百骑出河池州向黔，大军驻柳州接应。可望使李定国与冯双礼由黎平出靖州，马进忠由镇远出沅州，会于武冈，以图桂林，步骑八万。刘文秀与张先璧由永宁取叙州，白文选由遵义取重庆，会于嘉定，以图成都，步骑五万。疏闻安龙，封定国西宁王，文秀南康王，余各加公侯。从可望请也。
是月，南阳侯李元胤往海南招集散亡，至钦州之防城，为土兵王胜堂所执。绝粒九日。送靖南王，不屈。左右梃下，元胤笑曰：“鼎镬不惧，何有于梃？”又令作书招琼州杜永和，元胤曰：“杜将军缮兵穷海，差有丈夫气。乃招之耶。”靖南义之，使其故人往说之曰：“将军昔未受国恩耶？”元胤大恸曰：“某昔者不过帅府一亲人耳。今爵通侯，司禁旅，狼狈被擒，计惟一死报国。豫让不言之在前乎？吾父俟于九泉久矣。”故人曰：“李果将军父耶？”元胤曰：“岐阳、黔宁俱以养子自奋。子毋多言。”遂与弟建捷及前锋将李朝用俱被害。
五月，定国等进攻靖、沅、武冈，皆下之。定南王还守桂林。定国由西延大埠疾趋广西，败清师于严关。严关者，所由入桂林要道也。
七月四日，定国率诸军克桂林。定南奔入营中，怅然无一言，久之，曰：“已矣。”其妻曰：“勿虑我不死。”乃嘱一妪携其子出避，曰：“苟得免，度为沙弥。勿效乃父作贼一生，下场有今日耳。”遂自缢。定南赴火死。俘叛将陈邦传并其子曾禹送贵州，杀之。获定南一子，平西王婿也，因留于营。
刘文秀克叙州，白文选克重庆，平西王等回兵保宁。文秀由嘉定成都追至保宁。讨虏将军王复臣曰：“不可，我师骄矣，而彼方致死，以骄兵当死寇，能无失乎？”诸军皆不以为然。张先璧军其西南。先璧号黑神，军容耀日，然未经大敌。三桂登城望之曰：“独是军可袭。”乃出精骑犯其垒，果惊溃。转战而南。复臣手斩数人，环之者益众。乃曰：“大丈夫不生擒名王，岂可为敌所辱？”遂以刀自刭。清师皆惊叹以为烈士。文秀撤围而退。三桂不敢追，曰：“生平未见如此劲敌，特欠一著耳。”盖如复臣所云也。
报至滇，可望下令曰：“不听谋，损大将，刘抚南罪应诛。念有复城功，罢其职，闲住。”文秀归云南。
九月，李定国北取衡州。自南宁既败，胡一清、赵印选、马宝、曹志建等尚留粤西，屯聚山谷间。定国至，皆相率来归。民间亦多啸聚以应者。声势大振。孙可望亦自至沅州，使白文选、张虎攻辰州，下之，杀清总兵徐勇。长、岳相继奔溃。而清敬谨王率兵南下，十一月，遇定国于衡州，相持匝月。定国密令冯双礼率兵伏永州小路，而亲率所部决战。佯败至宝庆，复还奋击，伏兵起而夹攻。敬谨王大败。后得盔号，始知敬谨王亦死于乱军中。定国退屯武冈。
可望杀陈邦传，剥皮传尸至行在。大书于牌曰：“逆犯陈邦传，先经肆劫皇扛，镖掠宫人，罪已漏网。不思建功赎罪，辄行背主反叛。今已拿获，解赴军前，立将邦传父子剥皮，传示滇黔。”云云。绝无奏报之疏，遣人递送安龙即去。御史李如月疏劾孙可望擅杀，无人臣礼；邦传宜加恶谥，以惩其逆。疏上，留中。召如月入朝，面诘云：“谥法乃褒奖忠良字样，从无恶谥之例。尔小臣何得越典妄言？著革了职，于午门外廷杖四十。”张应科即入朝看科抄，科臣以本留中告，应科遂往如月署，索其疏稿。如月笑云：“何须用稿，自有揭帖，明早发来。”既而果遣人以揭帖投应科署云：大明山东道御史揭帖递至伪营提塘当官开拆。应科大怒，驰报可望。可望得报，即令应科杀如月，剥皮示众。乃缚如月至朝门，应科捧可望令旨，喝如月跪。如月叱曰：“我是朝廷命官，岂跪贼令？”乃步至中门，向阙再拜，大哭曰：“太祖高皇帝，我皇朝从此无谏臣矣。奸贼孙可望，汝死期不远。我死立千古之芳名，汝死遗万年之贼号，孰得孰失？”应科促令仆地，剖脊及臀。如月大呼云：“死得快活，浑身清凉。”又呼可望名大骂不绝口。及断手足，转前胸，犹微声恨骂，至颈绝而止。
时行宫湫隘，内监宫人非轮班入直者，皆居朝外。有宫人夏良璞者，年十九，聪敏殊丽，能诗，工真、草书，驰马试剑，皆绝技也。时居西城。应科朝罢过之，见良璞方据案作书，心动，即令民家妇出入通殷勤。又廉知良璞与巴东王妃结姊妹，常往来王第。应科所居适相对，遂馈遗巴东，交契甚密。王妃常出见，应科以嫂呼之。渐以良璞情事告，妃为诱致良璞通焉。后良璞昼入王第，夜宿应科署，益无忌惮。有密启司礼监者，遂以上闻。执良璞考讯，具得实。发内官杖毙。以内监知情不举，同杖死。赐巴东王及妃皆自缢。应科大怒。既而知庞司礼奏报，凌晨率数十人至司礼署，怒问天寿曰：“夏宫人有何罪过而致之死？”天寿曰：“此官家事，与卿何预？”应科语塞，手按其刃拟甘心于天寿者三。见有备，不敢动。已而马吉翔至，解之，乃密遣戎标参将张隆赍玺书，以良璞致死事告可望。可望已先得应科密报矣，谓张隆曰：“朝廷何苦因一宫人杀多命，孤当遣人去处应科，尔可同回。”其明日，传宣王爱秀同隆还，即以爱秀代应科，而令杖应科于朝门外，革其官，押解至黔。未几，委任如故。
永历七年（清顺治十年）癸巳正月戊辰朔，帝在安龙。
封李定国西宁郡王。定国自桂林胜后，不复禀可望约束。冯双礼与争卤获金帛，遂回黔，谮于可望。可望连发令箭调还，密令双礼总统，而以伪都督关有才等潜师蹑其后。有龚铭者，为定国中书，使黔，闻其事，即驰书间道密白定国。时讹言繁兴，有传定国滋不悦者，曰：“我奈何受郡王封？当亦如国主。”有传诸营偶语者，曰：“秦王下长沙，即改年号，受禅让矣。”及废处刘文秀，咸曰：“大功未行厚赏，偶败则膺严罚，我等如何苦捐身命？”又以杀杨畏知故，内外咸怨。是月，可望出师，慨然经略中原。其封定国诏使已出黔境，复追还之，曰：“孤今出师入楚，当面会安西，大庆宴，亲奉上敕以光宠之。”而众益交相论叹，以为此真项羽之元刂印吝封赏也。至有为定国虑者，曰：“此伪游云梦计耳。”当是时，定国已统兵过左江，克复柳州、庆远、南宁、太平诸城，而可望所遣令箭，一日三至。定国因涕泣谓其下曰：“不幸少陷军中，备尝险阻，思欲立尺寸功，匡扶王室，垂名不朽。今甫得斩名王，奏大捷，而猜疑四起。且我与刘抚南同起河南，战功具在。一旦诖误辄废弃，于我忌害，当必尤甚。我妻子俱在云南，我岂得已而奔哉？”将欲还师。俄得龚铭密报，知双礼等追兵将至，即遣精兵伏柳州江口芦荻中，俟双礼过迁江来宾二邑间，方逆之。双礼败回，伏发，一军皆陷，悉投江中。定国令纵双礼、有才还，易旗帜以诛逆为名，移师柳州，声言东下。可望闻，怅然久之。欲止军东下，然业已督师在道。又信其军士言：“敌殊易杀。亲履行间，立大功以服众心耳。”谍知敌屯回路江，遂欲袭击破之。令于军中曰：“凡获敌马者悉给之。时方四月，阴雨延连，行三日至回路江。敌惊欲溃。南军殊易之，甫斩数人，便掠其马。敌睨军乱，还南搏战。南军溃。清师鉴衡州之失，亦不追，遂各引还。而李定国于是遂据有广西。
行在闻之，君臣庆幸。计欲通好安西，密与内监张福禄、全为国、内阁吴贞毓、内翰蒋乾昌、李元开、御史李颀、周允吉、朱议昶、武安侯郑永元、大仆少卿赵赓禹、郎中张镌、蔡缤、朱东旦、中书易土佳、任斗虚、太常博士胡士瑞等谋。以马吉翔、庞天寿素党可望，秘不令闻。
八月，遣马吉翔往南宁省陵。既行，而贞毓等始撰敕及祷屏翰亲臣金章，以赐定国，许封晋王。
九月，遣主事林青阳、孔目周官，由间道趋柳州。
十月，青阳等至柳州，定国率官军郊迎。受读感激，泣数行下，军中皆流涕。遇青阳等有加礼焉。且云：“因系密敕，未敢复奏。俟恢复东粤，即来迎驾。”有刘议新者，自行营回，过南宁，为马吉翔言其状。吉翔虽赴南宁，留其弟雄飞在安龙觇动静。乍闻议新言，大惊曰：“不早自为地，事发，祸且及我辈矣。”阴使提塘王爱秀报可望。可望大怒，使人邀青阳，周官执之。并执马吉翔赴黔以待对理，阴厚待之。
是年，清师破广州，杜永和降。
永历八年（清顺治十一年）甲午正月壬辰朔，帝在云南。改云南为兴龙府。
可望遣伪指挥郑国至行在，言定国私通奸臣，要胁封爵，今使者已被执供明，乞查发同谋者付之，以报国主。帝谕曰：“事非内人所敢为。假敕假宝，外间多矣。”国怒而出，质之诸臣，皆曰不知。国曰：“有金章密旨差官姓名，岂同风影？”朝臣佯应曰：“是必文安侯马吉翔奉命谒陵，或携有先年视师空敕，因而填发，未可知也。”国即南去，械吉翔还朝面讯。吉翔力辨。于是职方司郎中张镌、御史周允吉、吏科徐吉应之曰：“此系我等所为。因我君臣性命悬于贼子之手，惟有藉安西一人，或可得延朱家国祚。今既事败，天也。生不能戮力王廷，死当为厉鬼以杀奸逆，奈何箝口以贻主上忧乎？”乃供同谋者吴贞毓等一十八人。国按名执禁，令锦衣卫康永宁会同严讯，备极五刑。因问谁为敕稿？镌曰：“我为之。”允吉曰：“改定者，我也。”问何由得宝？张福禄曰：“我为尚宝，宝由我盗用。”国曰：“此事必有主使。”盖意在连及帝也。遂复加毒楚。镌曰：“果有主使者。”国问为谁？镌厉声曰：“主使者，逆贼孙可望也。”国怒骂之。镌亦大骂。十八人皆同声不屈。既讯，以报可望。可望令磔张镌、张福禄、全为国三人，余俱斩。帝谕郑国，贞毓以辅臣处绞。镌等临刑犹从容入慰主上，挺然就戮，颜色不变。共相谓曰：“我等死后不可分离，须戮力同心，活擒秦逆，献之阙下。”因向阙拜而就死。吴贞毓绝命诗曰：“九世承恩未尽酬，忧时惆怅乏良谋。魂迷故国长依汉，梦绕高堂愧报刘（贞毓祖母，百岁尚在）。忠孝两穷嗟百折，匡扶有志藉同仇。击奸未破朱Г额，空竭丹心报国仇。”李元开诗曰：“忧愤呼天洒酒卮，六年心事恋王畿。生前痛为忠奸辨，身后宁知仆立碑。报国痴心终不死，还家春梦已无期。汨罗江上逢人语，惭愧无能续楚词。”蒋乾昌诗曰：“天地从来不可欺，寸心肯许世人知。奸臣误国非常惨，志士成仁自大悲。辛苦十年今已矣，间关千里竟何之？孤魂飘渺从风去，化作山河壮帝畿。”胡士瑞诗曰：“抚景千年恨，扪心一片丹。太阿柄已失，巢覆卵无完。夜雨青磷暗，秋风白骨寒。彼苍如可叩，封事死犹弹。”朱议昶有“精忠贯日吞河岳，傲骨凌霜砥浪涛”之句。余皆不传。安隆人哀之，后为祠以祀，称十八先生。
可望谕云南城守伪固原侯王尚礼，令籍定国宫眷并文武兵丁妇女，欲分配各营。尚礼虑大营分散，将滋内乱，乃三启止之。惟汰安西大营粮饷。尚礼遣女使馈茶果于王妃，实皆金银也。安西大营，赖是得济。
六月，孙可望自黔还滇，急谋僭号。及期，冕小不可冠。自辰及午后大雨，震雷交作。可望不怿而止，遂还贵州。
八月，可望设科取士，以慧光寺为贡院，取中陈士基等五十四人。
是月，定国破广东高州府，雷、连亦下。
永历九年（清顺治十二年）乙未正月丙戌朔，帝在兴龙府。
可望遣兵犯常德，败归。
秋，定国帅师围新会。
永历十年（清顺治十三年）丙申正月庚辰朔，帝在兴龙府。
时清平南王尚可喜率大兵救新会，击定国，败之。定国率残兵数千奔回南宁，标下高文贵、靳统武亦次第奔回。南宁驻镇不知虚实，奔黔告可望，谓定国将席卷而东。可望大惊，恐定国直入安龙，即调镇国刘启明等十三营，遣关有才统之，以拒定国。使白文选赴安龙促帝移黔。帝母子闻之哭。从官亦哭。白文选亦心非其所为，对之心动，因以情告曰：“姑缓行，俟西府至，可无危矣。”遂以舆徒不集报可望，阴以留俟定国。定国兼程疾进，先遣参将杨祥诈为营卒，诣行在，谒司礼庞天寿，于衣甲后心出密疏，署云藩臣李定国谨奏，而钤以屏翰亲臣赐章。天寿以闻。帝阅疏云：“臣今统兵迎扈，不日即至行畿。先遣奏安，万勿轻信奸逆，辄行移跸。”云云。帝稍安，然甚秘之。
关有才等见衣甲皆皂，又有捷取字号，则以为清师从天而下，遂跨马而逃。
二十一日夜半，白文选率步骑至安龙城外，大呼曰：“安西兵马即至矣，切须谨慎。”言毕，奔马而去。黎明，忽有叫门者曰：“我西府长随夏太监也。”遂令入朝面奏曰：“定国即至矣，遣臣先驰奏闻。因至冻洒箐，秦兵倒塞路，马不能前，所以少迟耳。”俄而周城炮起马嘶，声震数里，结寨遍九山头。安西率骑入朝陛见，君臣相持痛哭。帝谕曰：“久知卿忠义，恨相见之晚。”定国泣奏曰：“臣蒙陛下知遇之恩，欲取两粤以迎銮舆，乃不惟不副臣愿，且置陛下于重忧，臣万死无能自赎矣。”帝慰谕，赐坐及茶。定国还营，知文选去未远，遣夏太监等追留之。及于普平市，文选乃还，随定国入朝，密计幸滇。
二十六日，帝自安龙进次普安。遣兵守盘江，以御可望。
二月十一日，定国发前导后卫各骑卒三千，亲与白文选居中扈从，自新城普安直抵曲靖。请帝于行营安置，而亲率精兵入云南。时守滇者为刘文秀与王尚礼、王自奇等。文秀亦素怨可望，闻定国至，佯与王尚礼等勒兵，私以数骑驰迓定国曰：“我辈以秦王为董卓，尤恐卓后复有曹瞒。”定国为之指天誓。
三月，定国及文秀、文选等各率所部至曲靖，扈从銮舆入滇。以定北府为行宫，暂驻跸焉。改云南为滇都。赐定国晋王册宝，封文秀蜀王，文选巩国公，王尚礼保国公，王自奇夔国公，秦王扈卫张虎为淳化伯，水军都督李本高为崇信伯，高文贵广昌伯。又以定国记室金惟新为吏部侍郎，龚铭为兵部侍郎。马吉翔素党可望，知不为朝议所容，乃谄事维新及铭，为言于定国。五月得奏请，仍以文安侯入阁办事。
六月，遣白文选、张虎赍玺书还黔慰谕可望，宴辞，谕曰：“卿等往道朕意，务使两藩复敦旧好，事事为祖宗社稷起见。卿等功名垂竹帛矣。”文选等谢。往见可望，曰：“国主倘以旧好为念，不必苛求。若必欲擒之，假臣精兵二万，当立致定国于麾下。”可望以为诈，欲杀之。众救之，得免。乃夺文选所部兵并巩国公印，羁之营中，使张虎复命。然以妻子在滇，未敢显为逆也。
七月，光禄寺少卿高绩、御史邬昌期疏劾马吉翔、庞天寿以谗邪专擅，二藩与之友善，恐滋奸弊，复蹈可望故辙。疏上，两藩闻而不朝。帝以绩等妄言，谕廷杖革职。安西中书金维新趋渭定国曰：“绩与昌期罪固当死，而藩主则不宜留杀谏臣之名。”定国悟，驰救之，至则绩已死，而昌期得复原官。
八月，晋王李定国奏请归秦王宫眷，遣张虎护送至黔。定国亲饯之郊外。
十一日，移跸秦王宫，即云南府城中五华山地也。山有五华寺，为滇南诸刹之冠。于是初莅朝堂，二王侍立，文武肃然。朝贺出，皆喜相谓曰：“今日乃见真圣主也。”是日，帝为二王割襟，订二姓之盟。二王谢恩感悦。先是，定国有龙骧、天威二营，既出粤，祁三统龙骧营留蜀。可望令镇遵义。及定国入滇，调三，而可望亦使人调之。三谓其所部曰：“国主安西，旧主义均。今安西尊帝为民主，名正言顺，我等亦有所依，当遵西府之调为正。”众皆诺。于是却秦使，整旅还滇。可望遣兵追袭。三且战且走，辎重尽失。十月达行在。朝贺毕，即命封咸宁伯以旌忠正。
永历十一年（清顺治十四年）丁酉正月甲辰朔，帝在滇都。
可望遣伪臣程万里请大营及旧标还黔，许之。仍给夫马以送。
二月，起用先朝礼部尚书雷跃龙入阁办事。跃龙为可望所宠任，时告假在滇，故特起之。庞天寿以秦党自疑，惧晋王害之，忧愤病卒。赠恤甚隆，葬省城之华亭寺前。命太监李国泰掌司礼监事。
三月，以伪户部龚彝仍掌部事。彝以进士为先朝侍郎，可望任为户部者也。彝乃辞曰：“臣受秦王十年知遇，未有所报，安敢拜新命乎？”晋、蜀劾奏曰：“龚彝止知秦王十年之恩，独不念祖宗父子受国家三百载之恩乎？”有诏议处。彝伏阙免冠谢罪。降印局大使。数月，仍还原官。
初，可望在滇，伪兵部任馔屡表劝进。时馔已死，定国追论其谄逆。诏掘馔尸戮于市，籍其家，子孙俱遣边远充军。
四月，舟山监国鲁王遣总兵何达武赍表请会兵出吴、楚。
王自奇反于楚雄，率张明志、关有才二镇营兵西上永昌。
八月，举云南乡试，以演武场为贡院，取中王肇兴等五十四人。
可望自定国入滇，久谋内犯，畏定国兵强不敢骤发。因程万里奏请大营回黔，具以滇兵单将弱告可望。又诸镇自楚、粤至者皆聚于黔，所部甚众。遂大举犯阙。然人心多不直可望。马进忠、马惟兴、马宝以同姓相密，又与文选交，阴谋助定国，从容为可望言：“文选心膂旧人，诸将才望无出其右者，特前为定国所胁，使其心果向外，必不敢复来。今来而夺其兵，失归向心。试重用之，必能为国尽力。”可望信之，乃以文选为征逆招讨大将军，总统诸将前行。自率大军而进。留冯双礼守贵州。马进忠以病留安顺。可望令预造丑锁三百具，曰：“破滇之日，械送行在君臣也。”双礼力谏不听。及送师于郊，又谏曰：“国主往而果胜，难免犯阙之名。若其不济，则黔非国主有矣。”可望叱去。双礼痛哭而回。及师行在途，雨水泞泥，马多倒毙。抵交水，定国以沐天波、王尚礼、靳统武留守扈从，而亲与文秀督各镇兵御之。帝御五凤楼宴饯，簪花犒赏三军。时久雨忽霁，人心踊跃。
王尚礼素有异志。天波、统武精严城守，召尚礼入朝，悉收其兵器，以兵守之。天波素善流星锤，经乱每携袖中。是日恐左右有变，出锤舞，纵横掷击。尚礼俯首叹曰：“吾已为槛中虎，不复烦公攘臂也。”
九月朔，定国等兵至曲靖，屯于三岔。与可望接战，连北，退守曲靖，坚壁不出。
十四日，文选抵交水，距三岔二十里，轻骑奔定国军，且言人心内向，可一战走也。可望闻变欲还。马宝佯为切齿曰：“吾乃为跛贼所欺，要当手缚之，生食其肉。且一人去，何足重轻而废大事耶？”文选前为贼时，尝战伤足，医者生截他人足以接之。虽愈而跛，故宝呼跛贼云。可望乃止，曰：“两酋齐出，会城必虚。”因使马宝、张胜、武大定间道袭云南。
十八日，鄂国公马进忠密遣人报定国曰：“可望已使张胜等统锐卒三千袭云南矣。公可坐而待毙乎？”定国遂传令三鼓蓐食，五鼓发兵，攻之。可望大败，溃走白水。所随不及三百人，皆传宣官校。余悉陷没。于是急问左右马国公曰：“总总安在？”众应曰：“未败之先，白、马二营已归晋寨矣。”可望始大悔恨，曰：“冯双礼阻我兴师而坚不听，天亡我也。且仙台老僧能前知，尝问以出师凶吉，曰：‘惟不令白马相随，可无咎也。’初谓白马有碍于师行，既悉除不用，岂意其为进忠、文选乎？”因仰天大哭。复遇淋雨。既又谓其众曰：“昔年有石碑出水，镌文云‘来是观音面，去是老僧头，’由今推之，天意欲令我去发归清也。定国不世之仇，定须报复，我又岂惜此数茎头毛乎？”于是决计归清。